Le FC Metz héberge au Centre de Formation une quarantaine d'éléments. Ceux-ci peuvent choisir de poursuivre leur parcours scolaire dans différents lycées messins.
Dans la continuité de la préfo, les joueurs alternent études et football dans leur quotidien.

Les joueurs en Formation ont la possibilité d'être hébergés au Centre de Formation, qui dispose de 56 lits (voir la partie "Infrastructures"). Un service de restauration est assuré tout au long de la semaine pour les résidents par la société Eurest.
Au quotidien, les jeunes joueurs en formation sont entourés par une équipe pluridisciplinaire complète et variée. Nina Rechet, régisseur, assure le bon fonctionnement du centre et veille à ce que tout soit opérationnel. Evelyne Lopez, secrétaire, organise le suivi administratif des joueurs. Frédéric Schaeffler accompagne et épaule les internes dans leur vie quotidienne. Il effectue un suivi individualisé pour chacun d'entre eux et organise la vie collective du centre.
Les garçons ont le choix entre trois établissements pour leur parcours scolaire : les lycées Cormontaigne (enseignement général), Schuman (tertiaire) et Cassin (professionnel). Des cours de soutien leur sont dispensés en fin de journée par différents intervenants ponctuels. Ceux-ci sont gérés par la responsable pédagogique Giselle Bezon, qui accompagne chaque élément dans son cursus scolaire.
Grâce à un fonctionnement adapté aux exigences de la formation, le Centre parvient à amener la large majorité de ses garçons à un niveau d'étude satisfaisant. Ainsi, les jeunes joueurs messins ont depuis plusieurs années un taux de réussite au baccalauréat très important.

Pour accompagner les jeunes joueurs dans cette ultime étape que représente la Formation dans leur parcours, une équipe pédagogique tout aussi étoffée qu'en préformation :
Directeur de l'Association : Denis SCHAEFFER
Responsable de la Préformation : José PINOT

La saison débute mi août et se termine fin juin pour les jeunes de la Formation. L'effectif est divisé en deux groupes d'une vingtaine de joueurs chacun :
- les U19, anciens "18 ans";
- les U17, anciens "16 ans.
Les U17 et U19 sont inscrits dans les compétitions suivantes :
Les jeunes Messins sont régulièrement bien classés au sein du Championnat National. Cette compétition regroupe les meilleures équipes françaises, réparties dans quatre groupes différents. Si l'optimisation du potentiel de chaque joueur prime sur les résultats, faire bonne figure au sein des différentes compétitions reste un objectif. En 2007, les 16 ans ont ainsi été sacrés Champions de France, tandis que les 19 ans ont soulevé le trophée pour la dernière fois en 2010.
La formation prend aussi part à deux tournois internationaux :